宣威地区肺腺癌病人肺组织特异miRNAs表达谱和靶基因及其信号通路预测

目的筛选出宣威地区肺腺癌病人肺组织miRNAs差异表达谱,预测其相关靶基因和信号通路。方法选取来自宣威地区肺腺癌24例和非宣威地区肺腺癌10例患者手术切除的肺癌组织和正常肺组织标本,miRNAs芯片检测34对肺癌切除标本,筛选宣威肺腺癌miRNAs差异表达谱,AGO分析和KEGG Pathway分析预测其miRNAs的生物与肺癌相关的靶基因和信号通路。结果 miRNAs芯片检测:与非宣威肺腺癌比较,宣威肺腺癌差异表达显著的特异miRNAs 34个:表达上调的miRNAs有23个,表达下调的miRNAs有11个。AGO富集分析及KEGG数据库映射分析发现:预测主要集中在PI3K/Alt信号通路附...

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Published in:南方医科大学学报 2017 (2), p.238-244
Main Author: 陈帅 周永春 陈颖 陈小波 李光剑 杨加鹏 雷玉洁 赵光强 黄秋博 杨长绍 杜亚茜 黄云超
Format: Article
Language:Chinese
Subjects:
miRNA芯片
miRNAs
宣威肺腺癌
靶基因
信号通路
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Description
Summary:目的筛选出宣威地区肺腺癌病人肺组织miRNAs差异表达谱,预测其相关靶基因和信号通路。方法选取来自宣威地区肺腺癌24例和非宣威地区肺腺癌10例患者手术切除的肺癌组织和正常肺组织标本,miRNAs芯片检测34对肺癌切除标本,筛选宣威肺腺癌miRNAs差异表达谱,AGO分析和KEGG Pathway分析预测其miRNAs的生物与肺癌相关的靶基因和信号通路。结果 miRNAs芯片检测:与非宣威肺腺癌比较,宣威肺腺癌差异表达显著的特异miRNAs 34个:表达上调的miRNAs有23个,表达下调的miRNAs有11个。AGO富集分析及KEGG数据库映射分析发现:预测主要集中在PI3K/Alt信号通路附近,其预测靶基因有:GF、RTK、SOS、IRS1、BCAP、CYTOKINSR、ECM、ITGB、FAK和GβY,可能对肺癌生物学功能产生影响的靶基因主要集中在PI3K/Alt,WNT和MAPK通路。结论筛选出这些特异性miRNAs可能在宣威肺腺癌癌变和进展中起重要作用,预测的靶基因可能与调节PI3K/Alt,WNT和MAPK信号通路的作用有关。
ISSN:1673-4254