Signatures mutationnelles des carcinomes épidermoïdes cutanés survenant chez les patients atteints d’épidermolyse bulleuse dystrophique récessive

• Published in: Annales de dermatologie et de vénéréologie 2020-12, Vol.147 (12), p.A142-A143
• Main Authors: Ragot, H., Titeux, M., Barbieux, C., Gaucher, S., Hanein, S., Battistella, M., Boudan, R., Bourrat, E., Hovnanian, A.
• Format: Article
• Language: fre
• Subjects: Carcinome épidermoïde cutané; Epidermolyse bulleuse dystrophique récessive
• ISSN: 0151-9638
• DOI: 10.1016/j.annder.2020.09.130

L’épidermolyse bulleuse dystrophique récessive (EBDR) est une maladie cutanée héréditaire due à des mutations perte de fonction du gène COL7A1 codant le collagène de type 7. Les patients EBDR présentent une fragilité de la peau et des muqueuses responsable de bulles et érosions multiples et parfois diffuses entrainant des complications locales et systémiques dont la plus grave est le développement de carcinomes épidermoïdes cutanés (CEC), première cause de décès de ces patients. Il s’agit d’une étude prospective observationnelle mono-centrique incluant des patients EBDR adultes opérés à partir de 2016 dans notre centre de référence. L’objectif principal de notre étude était de caractériser les signatures moléculaires des CEC survenant chez ces patients. L’objectif secondaire est de comparer ces signatures moléculaires en fonction du caractère agressif ou non des tumeurs (critères clinico-histologiques recommandations SFD 2009). Les échantillons provenaient de pièces opératoires, extraites dans le cadre du traitement chirurgical habituel de ces tumeurs. Nous avons analysé l’ADN de ces tumeurs par séquençage nouvelle génération (NGS) à l’aide d’un panel de 383 gènes impliqués dans les cancers épithéliaux. L’ADN a été extrait de biopsies de peau tumorale et non-tumorale, afin d’exclure les variations germinales. Les mutations délétères et les signatures mutationnelles ont été analysées à l’aide du logiciel « Polyquery » et le package R « DeconstructSig » respectivement. Notre cohorte comprenait 18 patients dont les données épidémiologiques sont regroupées dans un tableau. Les analyses génomiques ont été réalisées à partir de 20 CEC chez 11 patients. Nous avons trouvé des signatures mutationnelles liées aux expositions aux UV (signature 7) et APOBEC (signature 2) précédemment rapportées dans la littérature. Nous avons par ailleurs identifié 53 gènes porteurs de mutations délétères récurrentes ou une variation du nombre de copies. Les gènes mutés sont notamment impliqués dans les voies de signalisation du cycle cellulaire, du système immunitaire, la transcription des gènes, et des voies des sérine/thréonine kinases. Nous avons identifié 27 autres gènes porteurs de variations délétères trouvées spécifiquement dans les tumeurs de 2 patients décédés rapidement de CEC métastasiques. Certaines de ces mutations pourraient altérer des voies de signalisation impliquées dans la transition épithélio-mésenchymateuse. L’approche NGS basée sur notre panel de 383 gènes liés