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Algoritmo para cálculo da proporção de genes idênticos por descendência, para mapear QTL em famílias de meio-irmãos

O desenvolvimento de mapas de ligação tem estimulado a procura por métodos que permitam mapear genes responsáveis por variação em loci de características quantitativas (QTL). O método de pares-de-irmãos com base na relação entre indivíduos idênticos por descendência (IBD) tem sido utilizado para map...

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Published in:Revista brasileira de zootecnia 2000-04, Vol.29 (2), p.443-451
Main Authors: Martinez, Mario Luiz(Embrapa Gado de Leite CNPGL), Vukasinovic, Natascha(Swiss Federal Institute of Technology)
Format: Article
Language:eng ; por
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Description
Summary:O desenvolvimento de mapas de ligação tem estimulado a procura por métodos que permitam mapear genes responsáveis por variação em loci de características quantitativas (QTL). O método de pares-de-irmãos com base na relação entre indivíduos idênticos por descendência (IBD) tem sido utilizado para mapear QTLs. O objetivo deste trabalho foi estender o método de HASEMAN e ELSTON (1972) para se estimar a proporção (pi) de genes IBD em famílias de meio-irmãos. Os resultados obtidos sugerem que os procedimentos usados foram eficientes para se estimar p, mesmo quando os genótipos dos pais foram parcial ou totalmente desconhecidos. The development of linkage maps has stimulated the search for methods to map genes involved with quantitative trait loci (QTL). A sib par method based on the relation between individuals identic by descent (IBD) has been used to map QTLs. The objective of this paper was to extend the HASEMAN and ELSTON (1972) method to estimate the proportion (pi) of genes IBD in half-sib families. The obtained results suggested that the used procedures were efficient to estimate p even when parents genotypes were partial or totally unknown.
ISSN:1516-3598
1806-9290
1806-9290
DOI:10.1590/S1516-35982000000200018