Isolation and molecular study of some bacterial urinary tract infections of sheep in basrah province

• Published in: Iraqi journal of agricultural science 2020-01, Vol.51 (3), p.885-893
• Main Authors: Muhammad, Yasamin Jasim, Mustafa, Jalal Yasin, Abd Allah, Ayah R.
• Format: Article
• Language: English
• Subjects: Bacteria; Bladder; Cystitis; Deoxyribonucleic acid; DNA; E coli; Females; Genes; Infections; Isolation of some bacterial, Urinary tract infection of Sheep; Kidneys; Klebsiella; Males; Pyelonephritis; Sheep; Urinary tract; Urinary tract diseases; Urinary tract infections; Urine; Urogenital system; Virulence; الأغنام; الالتهاب; البكتيريا الممرضة; المسالك البولية
• ISSN: 0075-0530; 2410-0862
• DOI: 10.36103/ijas.v51i3.1043

صممت هذه الدراسة لعزل و تشخيص جزيئي لبعض مسببات التهاب المجاري البولية المتضمن التهاب المثانة و التهاب الكلية (الاشريكيا القولونية، الكلبسيلا الرئوية) في الاغنام. من خلال جمع 108 عينة إدرار أغنام منها 56 عينة من النعاج و 52 عينة من الاكباش، كانت المصابة 60 عينه و بنسبة 55.55 % معزولة من الأغنام المجزورة، 36 (64.2% ) منها من الإناث و 24(46.1% ) من الذكور. العينات المصابة تضمنت 56 عزلة للاشريكيا القولونية و أربع عزلات للكلبسيلا الرئوية، جميع العزلات خضعت لاختبار الفايتك، الذي اظهر بدوره وجود 44 عزل للاشريكيا القولونية و عزلتان للكلبسيلا الرئوية، جميع هذه العزلات تم استخلاص منها الحامض النووي واجري عليها اختبار تفاعل البلمرة المستمر. أظهرت النتائج وجود جين FimH بنسبة 100% كون 44 عزلة للاشريكيا القولونية أظهرت نتائج موجبة، بينما اظهر جين pai نسبة 45.5% لنفس العزلات حيث ظهرت 20 عزلة بنتيجة موجبة من 44 عزلة. فيما اظهر جين Ecpa نتائج موجبة لعزلتي الكلبسيلا الرئوية و بنسبة 100% . This study was aimed isolation and molecular detection of some causative agents of urinary tract infection (cystitis and pyelonephritis). Out of 108 tested urine samples (56 from females and 52 from males); 60 samples (55.55% ) have infected with Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae were 36 (64.2% ) females and 24 (46.1% ) males. The sixty infected samples contain from 56 E. coli and (4) K. pneumoniae, this samples identified by Vitek 2 (44 isolates E. coli and 2 isolates K. pneumoniae) were subjected to DNA extraction. A total of 44 E. coli isolates detected to FimH and pai genes. 44/44 (100% ) were positive for presence of FimH gene, and 20/44 (45.45% ) were positive for presence of pai gene. The two isolates of K. pneumoniae which detection of Ecpa gene and given positive result to this gene 100% .