Species diversity and geographic distribution of Gymnotus (Pisces: Gymnotiformes) by nuclear (GGAC)n microsatellite analysis

• Published in: Genetics and molecular biology 2000-12, Vol.23 (4), p.803-807
• Main Authors: Fernandes-Matioli, F.M.C., Matioli, S.R., Almeida-Toledo, L.F.
• Format: Article
• Language: English
• Subjects: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY; GENETICS & HEREDITY
• ISSN: 1415-4757; 1678-4685; 1415-4757; 1678-4685
• DOI: 10.1590/S1415-47572000000400016

Patterns of amplified DNA fragments flanked by (GGAC)n microsatellites, obtained by single primer amplification reaction (SPAR), from 198 Gymnotus specimens (Pisces: Gymnotiformes) sampled from 8 southeastern Brazilian river basins were analyzed. The species studied were Gymnotus carapo, G. pantherinus, G. inaequilabiatus, and G. sylvius. The indirectly obtained patterns reflected the distribution of simple sequence repeats in the nuclear genome of the specimens. Species-specific patterns of DNA amplification were found and were useful for the analysis of the geographic distribution of Gymnotus species. Monomorphic patterns were found in G. carapo, G. pantherinus, and G. inaequilabiatus. Three polymorphic patterns were found in G. sylvius populations. The SPAR technique could be a useful molecular tool in conservation programs involving communities of neotropical freshwater fish. No presente estudo foram analisados os padrões de amplificação de fragmentos de DNA nuclear flanqueados por microssatélites (GGAC)n obtidos a partir de 198 exemplares do gênero Gymnotus (Pisces: Gymnotiformes) amostrados em 8 bacias hidrográficas do sudeste brasileiro. As espécies analisadas foram Gymnotus carapo, G. pantherinus, G. inaequilabiatus e G. sylvius. Os padrões de amplificação foram obtidos através da técnica de SPAR (single primer amplification reaction) e refletem, indiretamente, a distribuição de seqüências repetitivas simples no genoma nuclear dos espécimens. Foram encontrados padrões de amplificação espécie-específicos, os quais foram utilizados como potentes ferramentas na análise da distribuição geográfica e diversidade de espécies de Gymnotus. Padrões monomórficos foram observados em G. carapo, G. pantherinus e G. inaequilabiatus. Três padrões polimórficos foram verificados em G. sylvius. Os resultados obtidos através da técnica SPAR indicam que esta é uma abordagem promissora como ferramenta molecular em programas de conservação de comunidades de peixes de água doce neotropicais.