Characterization of mandarin citrus germplasm from Southern Brazil by morphological and molecular analyses

• Published in: Pesquisa agropecuaria brasileira 2003-07, Vol.38 (7), p.797-806
• Main Authors: Koehler-Santos, Patrícia(Universidade Federal do Rio Grande do Sul Instituto de Biociências Departamento de Genética), Dornelles, Ana Lúcia Cunha(Universidade Federal do Rio Grande do Sul Faculdade de Agronomia Departamento de Horticultura e Silvicultura), Freitas, Loreta Brandão de(Universidade Federal do Rio Grande do Sul Instituto de Biociências Departamento de Genética)
• Format: Article
• Language: English
• Subjects: AGRICULTURE, DAIRY & ANIMAL SCIENCE; AGRICULTURE, MULTIDISCIPLINARY; breeding methods; citros; citrus; genetic variation; microsatellites; microsatélites; método de melhoramento; variação genética
• ISSN: 0100-204X; 1678-3921; 1678-3921; 0100-204X
• DOI: 10.1590/S0100-204X2003000700003

The objective of this work was to characterize mandarin (Citrus spp.) germplasm from Southern Brazil by morphological and molecular analyses. Thirty seven cultivars from 34 distinct mandarin varieties were evaluated by morphological and agronomic traits of leaves, flowers and fruits, and by microsatellite markers. The morphological and agronomic characteristics suggested that almost all varieties can be produced for commercial use, and some, as the Satsuma variety, are recommended for breeding programs. Pooled DNA samples from 1-5 plants belonging to each cultivar were tested. Eight of the nine primers detected polymorphisms. Specific markers were found for some accessions. The dendrogram constructed with the morphological results divided the 37 cultivars into four groups, while that obtained with the microsatellites clustered 35 of the 37 cultivars into three groups only. Generally, intervarietal differences are not high, and this lack of agreement in the two multifactorial analyses indicates that diverse evolutionary factors are acting at these two levels of investigation. O objetivo deste trabalho foi caracterizar o germoplasma de tangerineiras (Citrus spp.) por meio de análises morfológicas e moleculares. Trinta e sete cultivares, pertencentes a 34 variedades distintas de tangerineiras, foram avaliadas pelas características morfológicas e agronômicas de folhas, flores e frutos, bem como por análises de microssatélites. As características morfológicas e agronômicas sugerem que praticamente todas as variedades podem ser usadas comercialmente e algumas delas, como a variedade Satsuma, são recomendadas para uso em cruzamentos dirigidos. O DNA foi obtido de amostras extraídas de uma a cinco plantas de cada cultivar. Oito de nove primers detectaram polimorfismos. Foram encontrados marcadores específicos para alguns acessos. O dendrograma construído com os resultados morfológicos dividiu as 37 cultivares em quatro grupos, enquanto o obtido com os microssatélites agrupou 35 das 37 cultivares em três grupos. As diferenças intervarietais não são grandes, e esta falta de concordância nas duas análises multivariadas indica que fatores evolutivos diversos estão agindo nesses dois níveis de investigação.