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Genetic characterization of rabies virus isolated from bovines and equines between 2007 and 2008, in the States of São Paulo and Minas Gerais Caracterização genética de vírus da raiva isolado de bovinos e equinos entre 2007 e 2008, nos Estados de São Paulo e Minas Gerais
INTRODUCTION: Rabies is an acute disease of the central nervous system and is responsible for the deaths of thousands of humans, wild animals and livestock, particularly cattle, as well as causing major economic losses. This study describes the genetic characterization of rabies virus variants that...
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Published in: | Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical 2010-04, Vol.43 (2), p.116-120 |
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Format: | Article |
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creator | Carla Isabel Macedo Pedro Carnieli Junior Willian de Oliveira Fahl Jonas Yoshitaka de Oliveira Lima Rafael de Novaes Oliveira Samira Maria Achkar Juliana Galera Castilho Maria Luiza Carrieri Ivanete Kotait |
description | INTRODUCTION: Rabies is an acute disease of the central nervous system and is responsible for the deaths of thousands of humans, wild animals and livestock, particularly cattle, as well as causing major economic losses. This study describes the genetic characterization of rabies virus variants that circulate in Desmodus rotundus populations and are transmitted to herbivores. METHODS: Fifty rabies virus isolates from bovines and equines in the States of São Paulo and Minas Gerais, Brazil, were genetically characterized and compared with sequences retrieved from GenBank. RESULTS: Two clusters (I and II) with mean nucleotide identities of 99.1 and 97.6% were found. The first of these contained nearly all the samples analyzed. Lineages from other Brazilian states grouped in cluster II. CONCLUSIONS: Analysis of the amino acid sequences of the N proteins revealed the existence of genetic markers that may indicate possible variations between geographic regions, although the biologically active regions are conserved within the species over space and time.INTRODUÇÃO: A raiva é uma doença aguda do sistema nervoso central e é responsável por mortes de milhares de humanos, animais silvestres e animais de criação - especialmente bovinos - além de causar elevadas perdas econômicas. Este trabalho descreve a caracterização genética das variantes do vírus da raiva que circulam em populações de Desmodus rotundus e são transmitidas aos herbívoros. MÉTODOS: Cinquenta isolados de vírus da raiva de bovinos e equinos provenientes dos Estados de São Paulo e Minas Gerais, Brasil, foram caracterizadas geneticamente e comparadas com sequências recuperadas do GenBank. RESULTADOS: Dois clusters, I e II, apresentando identidades médias de nucleotídeos de 99,1 e 97,6%, foram obtidos, sendo o primeiro composto de quase a totalidade das amostras analisadas. Linhagens de outros estados do Brasil "clustered" no II. CONCLUSÕES: A análise das sequências de aminoácidos da proteína N revelou que existem marcadores genéticos que podem determinar uma possível regionalidade embora as regiões biologicamente ativas apresentem-se conservadas dentro das espécies ao longo do tempo e espaço. |
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This study describes the genetic characterization of rabies virus variants that circulate in Desmodus rotundus populations and are transmitted to herbivores. METHODS: Fifty rabies virus isolates from bovines and equines in the States of São Paulo and Minas Gerais, Brazil, were genetically characterized and compared with sequences retrieved from GenBank. RESULTS: Two clusters (I and II) with mean nucleotide identities of 99.1 and 97.6% were found. The first of these contained nearly all the samples analyzed. Lineages from other Brazilian states grouped in cluster II. CONCLUSIONS: Analysis of the amino acid sequences of the N proteins revealed the existence of genetic markers that may indicate possible variations between geographic regions, although the biologically active regions are conserved within the species over space and time.INTRODUÇÃO: A raiva é uma doença aguda do sistema nervoso central e é responsável por mortes de milhares de humanos, animais silvestres e animais de criação - especialmente bovinos - além de causar elevadas perdas econômicas. Este trabalho descreve a caracterização genética das variantes do vírus da raiva que circulam em populações de Desmodus rotundus e são transmitidas aos herbívoros. MÉTODOS: Cinquenta isolados de vírus da raiva de bovinos e equinos provenientes dos Estados de São Paulo e Minas Gerais, Brasil, foram caracterizadas geneticamente e comparadas com sequências recuperadas do GenBank. RESULTADOS: Dois clusters, I e II, apresentando identidades médias de nucleotídeos de 99,1 e 97,6%, foram obtidos, sendo o primeiro composto de quase a totalidade das amostras analisadas. Linhagens de outros estados do Brasil "clustered" no II. CONCLUSÕES: A análise das sequências de aminoácidos da proteína N revelou que existem marcadores genéticos que podem determinar uma possível regionalidade embora as regiões biologicamente ativas apresentem-se conservadas dentro das espécies ao longo do tempo e espaço.</description><identifier>ISSN: 0037-8682</identifier><identifier>EISSN: 1678-9849</identifier><identifier>DOI: 10.1590/S0037-86822010000200002</identifier><language>eng</language><publisher>Sociedade Brasileira de Medicina Tropical (SBMT)</publisher><subject>Bovinos ; Caracterização genética ; Cattle ; Desmodus rotundus ; Gene da nucleoproteína ; Genetic characterization ; Nucleoprotein gene ; Rabies virus ; Vírus da raiva</subject><ispartof>Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical, 2010-04, Vol.43 (2), p.116-120</ispartof><lds50>peer_reviewed</lds50><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><link.rule.ids>314,780,784,27923,27924</link.rule.ids></links><search><creatorcontrib>Carla Isabel Macedo</creatorcontrib><creatorcontrib>Pedro Carnieli Junior</creatorcontrib><creatorcontrib>Willian de Oliveira Fahl</creatorcontrib><creatorcontrib>Jonas Yoshitaka de Oliveira Lima</creatorcontrib><creatorcontrib>Rafael de Novaes Oliveira</creatorcontrib><creatorcontrib>Samira Maria Achkar</creatorcontrib><creatorcontrib>Juliana Galera Castilho</creatorcontrib><creatorcontrib>Maria Luiza Carrieri</creatorcontrib><creatorcontrib>Ivanete Kotait</creatorcontrib><title>Genetic characterization of rabies virus isolated from bovines and equines between 2007 and 2008, in the States of São Paulo and Minas Gerais Caracterização genética de vírus da raiva isolado de bovinos e equinos entre 2007 e 2008, nos Estados de São Paulo e Minas Gerais</title><title>Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical</title><description>INTRODUCTION: Rabies is an acute disease of the central nervous system and is responsible for the deaths of thousands of humans, wild animals and livestock, particularly cattle, as well as causing major economic losses. This study describes the genetic characterization of rabies virus variants that circulate in Desmodus rotundus populations and are transmitted to herbivores. METHODS: Fifty rabies virus isolates from bovines and equines in the States of São Paulo and Minas Gerais, Brazil, were genetically characterized and compared with sequences retrieved from GenBank. RESULTS: Two clusters (I and II) with mean nucleotide identities of 99.1 and 97.6% were found. The first of these contained nearly all the samples analyzed. Lineages from other Brazilian states grouped in cluster II. CONCLUSIONS: Analysis of the amino acid sequences of the N proteins revealed the existence of genetic markers that may indicate possible variations between geographic regions, although the biologically active regions are conserved within the species over space and time.INTRODUÇÃO: A raiva é uma doença aguda do sistema nervoso central e é responsável por mortes de milhares de humanos, animais silvestres e animais de criação - especialmente bovinos - além de causar elevadas perdas econômicas. Este trabalho descreve a caracterização genética das variantes do vírus da raiva que circulam em populações de Desmodus rotundus e são transmitidas aos herbívoros. MÉTODOS: Cinquenta isolados de vírus da raiva de bovinos e equinos provenientes dos Estados de São Paulo e Minas Gerais, Brasil, foram caracterizadas geneticamente e comparadas com sequências recuperadas do GenBank. RESULTADOS: Dois clusters, I e II, apresentando identidades médias de nucleotídeos de 99,1 e 97,6%, foram obtidos, sendo o primeiro composto de quase a totalidade das amostras analisadas. Linhagens de outros estados do Brasil "clustered" no II. 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This study describes the genetic characterization of rabies virus variants that circulate in Desmodus rotundus populations and are transmitted to herbivores. METHODS: Fifty rabies virus isolates from bovines and equines in the States of São Paulo and Minas Gerais, Brazil, were genetically characterized and compared with sequences retrieved from GenBank. RESULTS: Two clusters (I and II) with mean nucleotide identities of 99.1 and 97.6% were found. The first of these contained nearly all the samples analyzed. Lineages from other Brazilian states grouped in cluster II. 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RESULTADOS: Dois clusters, I e II, apresentando identidades médias de nucleotídeos de 99,1 e 97,6%, foram obtidos, sendo o primeiro composto de quase a totalidade das amostras analisadas. Linhagens de outros estados do Brasil "clustered" no II. CONCLUSÕES: A análise das sequências de aminoácidos da proteína N revelou que existem marcadores genéticos que podem determinar uma possível regionalidade embora as regiões biologicamente ativas apresentem-se conservadas dentro das espécies ao longo do tempo e espaço.</abstract><pub>Sociedade Brasileira de Medicina Tropical (SBMT)</pub><doi>10.1590/S0037-86822010000200002</doi><oa>free_for_read</oa></addata></record> |
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