Genetic diversity of 11 European pig breeds [molecular marker, conservation]

Un ensemble de onze races porcines en provenance de six pays europeens, et incluant un petit echantillon de sangliers, a ete choisi pour une etude de diversite genetique. Cette diversite a ete evaluee sur la base de 18 marqueurs microsatellites types sur un total de 483 echantillons d'ADN. Les...

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Published in:Genetics selection evolution (Paris) 2000-03, Vol.32 (2)
Main Authors: Laval, G. (Institut National de la Recherche Agronomique, Castanet Tolosan (France). Centre de Toulouse, Genetique Cellulaire), Iannuccelli, N, Legault, C, Milan, D, Groenen, M.A.M, Giuffra, E, Andersson, L, Nissen, P.H, Joergensen, C.B, Beeckmann, P, Geldermann, H, Foulley, J.L, Chevalet, C, Ollivier, L
Format: Article
Language:English
Subjects:
BREEDS (ANIMALS)
CERDO
CONSERVACION DEL GERMOPLASMA
CONSERVATION DU MATERIEL GENETIQUE
GENETIC MARKERS
GENETIC VARIATION
GERMPLASM CONSERVATION
MARCADORES GENETICOS
MARQUEUR GENETIQUE
PORCIN
RACE (ANIMAL)
RAZAS (ANIMALES)
SWINE
VARIACION GENETICA
VARIATION GENETIQUE
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Description
Summary:Un ensemble de onze races porcines en provenance de six pays europeens, et incluant un petit echantillon de sangliers, a ete choisi pour une etude de diversite genetique. Cette diversite a ete evaluee sur la base de 18 marqueurs microsatellites types sur un total de 483 echantillons d'ADN. Les races etudiees manifestent un taux d'heterozygotie allant de 035 a 0,60. Les locus sont en equilibre de Hardy-Weinberg a l'exception du cas des races allemandes Landrace et Schwaebisch-Haellisches, qui manifestent un deficit d'heterozygotes. L'indice de differenciation entre races est eleve (FST global de 0,27) et les distances genetiques entre individus permettent de les regrouper pratiquement en 11 ensembles distincts, correspondant aux 11 races considerees. Les distances genetiques entre races ont d'abord ete utilisees pour construire des arbres phylogenetiques. Ces arbres suggerent qu'un modele de derive genetique pourrait expliquer la divergence des deux races allemandes, mais aucune phylogenie fiable n'a pu etre etablie entre les races restantes. Les memes distances ont ensuite ete utilisees pour mesurer la diversite genetique globale de l'ensemble et evaluer la perte marginale de diversite associee a chacune des races etudiees. De ce point de vue, la race francaise Basque apparait comme la plus originale dans l'ensemble considere. Cette etude, qui reste a etendre a un plus grand nombre de races europeennes, indique que l'utilisation des distances entre races animales domestiques dans une approche taxonomique classique risque d'avoir un faible pouvoir de resolution, mais elle souligne l'interet de les utiliser plutot pour des evaluations prospectives de diversite
ISSN:0999-193X
1297-9686