Genetic Polymorphism of Fusarium Culmorum Isolates Originating from Roots and Stem Bases of Barley

Fusarium culmorum is an etiologic agent of barley foot rot. The identification and variability evaluation of F. culmorum isolates, originating from roots and stem bases of spring barley, was carried out using molecular methods. Species-specific SCAR primers were successfully applied to identify F. c...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Journal of plant protection research 2008-09, Vol.48 (3), p.303-312
Main Authors: Irzykowska, Lidia, Baturo, Anna
Format: Article
Language:English
Subjects:
barley
molecular markers
PCR
stem base disease
Citations: Items that this one cites
Items that cite this one
Online Access:Get full text
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Description
Summary:Fusarium culmorum is an etiologic agent of barley foot rot. The identification and variability evaluation of F. culmorum isolates, originating from roots and stem bases of spring barley, was carried out using molecular methods. Species-specific SCAR primers were successfully applied to identify F. culmorum isolates from northern and south-eastern Poland. To determine DNA polymorphism on intraspecies level RAPD technique was used. Twenty three RAPD markers revealed DNA polymorphism suitable to assess genetic variation among isolates examined. Cluster analysis of RAPD data identified a few groups of isolates. In some cases grouping of isolates was correlated with their geographic origin. Fusarium culmorum jest czynnikiem etiologicznym fuzaryjnej zgorzeli podstawy źdźbła i korzeni jęczmienia. Posługując się metodami molekularnymi przeprowadzono identyfikację i ocenę zróżnicowania izolatów F. culmorum pochodzących z korzeni i podstawy źdźbła jęczmienia jarego. Gatunkowo-specyficzne startery SCAR z powodzeniem zastosowano do identyfikacji izolatów F. culmorum z północnej i południowo-wschodniej Polski. W celu określenia polimorfizmu DNA na poziomie wewnątrzgatunkowym zastosowano technikę RAPD. Dwadzieścia trzy markery RAPD ujawniły polimorfizm wystarczający do oceny genetycznego zróżnicowania badanych izolatów. Za pomocą analizy klasterów danych RAPD wyznaczono kilka grup izolatów. W niektórych przypadkach grupowanie izolatów było związane z ich geograficznym pochodzeniem.
ISSN:1427-4345
1899-007X
DOI:10.2478/v10045-008-0039-0