Molecular epidemiology of methicillin‐resistant Staphylococcus aureus in the Brazilian primary health care system

• Published in: Tropical medicine & international health 2019-03, Vol.24 (3), p.339-347
• Main Authors: Pereira‐Franchi, Eliane Patricia Lino, Barreira, Maria Rachel Nogueira, Costa, Natália de Sousa Lima Moreira, Riboli, Danilo Flávio Moraes, Abraão, Ligia Maria, Martins, Katheryne Benini, Victória, Cassiano, Cunha, Maria de Lourdes Ribeiro de Souza da
• Format: Article
• Language: English
• Subjects: Biofilms; Density; Drug resistance; Electrophoresis; Enterotoxins; Epidemiology; Gel electrophoresis; Genes; Leukocidin; Methicillin; methicillin‐resistant Staphylococcus aureus; Multilocus sequence typing; Pathogens; Patients; Penicillin; plaies; primary health care; Public health; SARM; Septic shock; soins de santé primaires; Staphylococcal enterotoxin F; Staphylococcus aureus; Staphylococcus infections; Toxic shock syndrome; Toxins; Virulence; Wounds; épidémiologie
• ISSN: 1360-2276; 1365-3156
• DOI: 10.1111/tmi.13192

Objective To evaluate the molecular epidemiology and to georeference Staphylococcus aureus isolated from wounds and nares of patients seen at Basic Health Units (BHUs) of a Brazilian city. Methods Observational, cross‐sectional study conducted from 2010 to 2013. A total of 119 S. aureus strains isolated from the wounds and nares of 88 patients were studied. The isolates were characterised by identifying virulence genes encoding enterotoxins A–E, haemolysins α, β and δ, exfoliatins A, B and D, biofilm production, Panton‐Valentine Leukocidin and toxic shock syndrome toxin 1, and by pulsed‐field gel electrophoresis (PFGE), multilocus sequence and spa typing. Results Eighteen methicillin‐resistant Staphylococcus aureus (MRSA) (6 SCCmec type II and 12 SCCmec type IV) and 101 (85%) MSSA were identified. PFGE typing resulted in the formation of eight clusters, with STs 1, 5, 8, 30, 188, 1176 and 1635 and spa type t002 being the predominant types among MSSA. The 18 MRSA belonged to STs 5, 8 and 1176 and spa types t002 and t062. Conclusion The results demonstrate widespread dissemination of MSSA and MRSA clones carrying haemolysin, biofilm and toxin genes. Kernel density estimation revealed the highest density of S. aureus in the 4, 5 and 8 BHUs. Objectif Evaluer l’épidémiologie moléculaire et géoréférencer le Staphylococcus aureus isolé de plaies et de narines de patients vus dans les unités sanitaires de base (BHU) d'une ville brésilienne. Méthodes Etude observationnelle transversale réalisée de 2010 à 2013. Au total, 119 souches de S. aureus isolées de plaies et de narines de 88 patients ont été étudiées. Les isolats ont été caractérisés par l'identification de gènes de virulence codant pour les entérotoxines AE, les hémolysines α, β et δ, les exfoliatines A, B et D, la production de biofilm, la leucocidine de Panton‐Valentine et la toxine 1 du syndrome de choc toxique, et par typage par électrophorèse sur gel en champ pulsé (PFGE), séquence multilocus et spa. Résultats Dix‐huit SARM (6 de type II SCCmec et 12 de type IV SCCmec) et 101 (85%) SASM ont été identifiés. Le typage PFGE a résulté à l'obtention de huit grappes, dont STs 1, 5, 8, 30, 188, 1176 et 1635 et le type spa t002 étant les types prédominants parmi les SASM. Les 18 SARM appartenaient aux STs 5, 8 et 1176 et aux types de spa t002 et t062. Conclusion Les résultats démontrent une dissémination étendue des clones de SASM et de SARM portant les gènes de l'hémolysine, de biofilm et de toxine. L'estimat