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Genetic structure and gene flow of Eugenia dysenterica natural populations
This study was carried out to assess the genetic variability of ten "cagaita" tree (Eugenia dysenterica) populations in Southeastern Goiás. Fifty-four randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) loci were used to characterize the population genetic variability, using the analysis of molecula...
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Published in: | Pesquisa agropecuaria brasileira 2005-10, Vol.40 (10), p.975-980 |
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Format: | Article |
Language: | English |
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creator | Zucchi, M.I |
description | This study was carried out to assess the genetic variability of ten "cagaita" tree (Eugenia dysenterica) populations in Southeastern Goiás. Fifty-four randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) loci were used to characterize the population genetic variability, using the analysis of molecular variance (AMOVA). A phiST value of 0.2703 was obtained, showing that 27.03% and 72.97% of the genetic variability is present among and within populations, respectively. The Pearson correlation coefficient (r) among the genetic distances matrix (1 - Jaccard similarity index) and the geographic distances were estimated, and a strong positive correlation was detected. Results suggest that these populations are differentiating through a stochastic process, with restricted and geographic distribution dependent gene flow.
Este trabalho teve por objetivo o estudo da variabilidade genética em 10 populações de cagaiteiras (Eugenia dysenterica), da região Sudeste do Estado de Goiás. Foram identificados 54 locos marcadores RAPD, para a caracterização da variabilidade genética, avaliada por meio da análise da variância molecular (AMOVA). Foi verificado que 27,03% da variabilidade genética está entre populações, e 72,97% dentro de populações, índices obtidos a partir do valor de fiST igual a 0,2703. Foi estimado o coeficiente de correlação de Pearson (r) entre a matriz de distâncias genéticas (1 - índice de similaridade de Jaccard) e de distâncias geográficas, tendo sido encontrada forte correlação positiva. Os resultados sugerem que essas populações estão se diferenciando por um processo estocástico havendo fluxo restrito dependente da distribuição geográfica. |
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Este trabalho teve por objetivo o estudo da variabilidade genética em 10 populações de cagaiteiras (Eugenia dysenterica), da região Sudeste do Estado de Goiás. Foram identificados 54 locos marcadores RAPD, para a caracterização da variabilidade genética, avaliada por meio da análise da variância molecular (AMOVA). Foi verificado que 27,03% da variabilidade genética está entre populações, e 72,97% dentro de populações, índices obtidos a partir do valor de fiST igual a 0,2703. Foi estimado o coeficiente de correlação de Pearson (r) entre a matriz de distâncias genéticas (1 - índice de similaridade de Jaccard) e de distâncias geográficas, tendo sido encontrada forte correlação positiva. Os resultados sugerem que essas populações estão se diferenciando por um processo estocástico havendo fluxo restrito dependente da distribuição geográfica.</description><identifier>ISSN: 0100-204X</identifier><identifier>ISSN: 1678-3921</identifier><identifier>EISSN: 1678-3921</identifier><identifier>EISSN: 0100-204X</identifier><identifier>DOI: 10.1590/s0100-204x2005001000005</identifier><language>eng</language><publisher>Embrapa Secretaria de Pesquisa e Desenvolvimento; Pesquisa Agropecuária Brasileira</publisher><subject>AGRICULTURE, DAIRY & ANIMAL SCIENCE ; AGRICULTURE, MULTIDISCIPLINARY ; CAGAITA ; CERRADO ; EUGENIA ; GENETIC MARKERS ; GENETIC VARIATION ; GENÉTICA VEGETAL ; MARCADOR MOLECULAR ; MARCADORES GENETICOS ; MARQUEUR GENETIQUE ; PLANT POPULATION ; POBLACION VEGETAL ; POPULATION VEGETALE ; POPULAÇÃO DE PLANTA ; SABANAS ; SAVANE ; SAVANNAS ; VARIACION GENETICA ; VARIATION GENETIQUE ; VARIAÇÃO GENÉTICA</subject><ispartof>Pesquisa agropecuaria brasileira, 2005-10, Vol.40 (10), p.975-980</ispartof><rights>This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.</rights><lds50>peer_reviewed</lds50><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed><citedby>FETCH-LOGICAL-c367t-54994d3841fa465bef44f1adac0b37f67f768802b078a2df893cf9fff70525153</citedby><cites>FETCH-LOGICAL-c367t-54994d3841fa465bef44f1adac0b37f67f768802b078a2df893cf9fff70525153</cites></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><link.rule.ids>230,314,776,780,881,24129,27901,27902</link.rule.ids></links><search><creatorcontrib>Zucchi, M.I</creatorcontrib><title>Genetic structure and gene flow of Eugenia dysenterica natural populations</title><title>Pesquisa agropecuaria brasileira</title><addtitle>Pesq. agropec. bras</addtitle><description>This study was carried out to assess the genetic variability of ten "cagaita" tree (Eugenia dysenterica) populations in Southeastern Goiás. Fifty-four randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) loci were used to characterize the population genetic variability, using the analysis of molecular variance (AMOVA). A phiST value of 0.2703 was obtained, showing that 27.03% and 72.97% of the genetic variability is present among and within populations, respectively. The Pearson correlation coefficient (r) among the genetic distances matrix (1 - Jaccard similarity index) and the geographic distances were estimated, and a strong positive correlation was detected. Results suggest that these populations are differentiating through a stochastic process, with restricted and geographic distribution dependent gene flow.
Este trabalho teve por objetivo o estudo da variabilidade genética em 10 populações de cagaiteiras (Eugenia dysenterica), da região Sudeste do Estado de Goiás. Foram identificados 54 locos marcadores RAPD, para a caracterização da variabilidade genética, avaliada por meio da análise da variância molecular (AMOVA). Foi verificado que 27,03% da variabilidade genética está entre populações, e 72,97% dentro de populações, índices obtidos a partir do valor de fiST igual a 0,2703. Foi estimado o coeficiente de correlação de Pearson (r) entre a matriz de distâncias genéticas (1 - índice de similaridade de Jaccard) e de distâncias geográficas, tendo sido encontrada forte correlação positiva. 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Fifty-four randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) loci were used to characterize the population genetic variability, using the analysis of molecular variance (AMOVA). A phiST value of 0.2703 was obtained, showing that 27.03% and 72.97% of the genetic variability is present among and within populations, respectively. The Pearson correlation coefficient (r) among the genetic distances matrix (1 - Jaccard similarity index) and the geographic distances were estimated, and a strong positive correlation was detected. Results suggest that these populations are differentiating through a stochastic process, with restricted and geographic distribution dependent gene flow.
Este trabalho teve por objetivo o estudo da variabilidade genética em 10 populações de cagaiteiras (Eugenia dysenterica), da região Sudeste do Estado de Goiás. Foram identificados 54 locos marcadores RAPD, para a caracterização da variabilidade genética, avaliada por meio da análise da variância molecular (AMOVA). Foi verificado que 27,03% da variabilidade genética está entre populações, e 72,97% dentro de populações, índices obtidos a partir do valor de fiST igual a 0,2703. Foi estimado o coeficiente de correlação de Pearson (r) entre a matriz de distâncias genéticas (1 - índice de similaridade de Jaccard) e de distâncias geográficas, tendo sido encontrada forte correlação positiva. Os resultados sugerem que essas populações estão se diferenciando por um processo estocástico havendo fluxo restrito dependente da distribuição geográfica.</abstract><pub>Embrapa Secretaria de Pesquisa e Desenvolvimento; Pesquisa Agropecuária Brasileira</pub><doi>10.1590/s0100-204x2005001000005</doi><tpages>6</tpages><oa>free_for_read</oa></addata></record> |
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identifier | ISSN: 0100-204X |
ispartof | Pesquisa agropecuaria brasileira, 2005-10, Vol.40 (10), p.975-980 |
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subjects | AGRICULTURE, DAIRY & ANIMAL SCIENCE AGRICULTURE, MULTIDISCIPLINARY CAGAITA CERRADO EUGENIA GENETIC MARKERS GENETIC VARIATION GENÉTICA VEGETAL MARCADOR MOLECULAR MARCADORES GENETICOS MARQUEUR GENETIQUE PLANT POPULATION POBLACION VEGETAL POPULATION VEGETALE POPULAÇÃO DE PLANTA SABANAS SAVANE SAVANNAS VARIACION GENETICA VARIATION GENETIQUE VARIAÇÃO GENÉTICA |
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