18S-rDNA SEQUENCING, ENZYME PATTERNS AND MORPHOLOGICAL CHARACTERIZATION OF TRICHOPHYTON ISOLATES

• Published in: Brazilian journal of microbiology 2001-10, Vol.32 (3), p.179-186
• Main Authors: Nascimento, Adriana Mendes do(Universidade de São Paulo Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto Departamento de Genética), Martinez-Rossi, Nilce M.(Universidade de São Paulo Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto Departamento de Genética)
• Format: Article
• Language: English
• Subjects: 18S-rDNA sequencing; dermatophyte; dermatófito; enzimas extracelulares; extracellular enzymes; MICROBIOLOGY; seqüenciamento do DNA ribossomal 18S; Trichophyton; Trichophyton rubrum
• ISSN: 1517-8382; 1678-4405; 1678-4405
• DOI: 10.1590/S1517-83822001000300004

Dermatophytes, capable to use keratin of the host for nutrition, belong to one of the major groups of pathogenic fungi. Since dermatophytes are a closely related group they share various common features, and the morphology of isolates of a given species can be atypical, making species identification and differentiation even more difficult. Many methods have been explored in attempts to distinguish dermatophytes, but the combined use of different approaches for the investigation of the intraspecific and interspecific variability of Trichophyton continues to be scarce. Some studies have shown that amplified fragments of the small ribosomal DNA subunit 18S contains variable regions which can be used to discriminate between medically relevant yeast species, indicating that these regions could also be used for differentiation between dermatophytes. In our study, sequence analysis of the 18S-rDNA gene was combined with morphological and biochemical criteria in order to detect genetic differences between seven Trichophyton isolates and estimate their phylogenetic relationships. The results show that the isolates investigated belong to the Trichophyton group, which potentially contains the Trichophyton rubrum cluster. Os dermatófitos formam um dos principais grupos de fungos patogênicos, caracterizados pela utilização da queratina do hospedeiro para sua nutrição. Por se constituírem um grupo de fungos intimamente relacionados, compartilham uma série de características comuns. Além disto, a morfologia de isolados de determinadas espécies pode ser atípica, tornando a identificação das espécies ainda mais difícil. Muitos métodos vêm sendo explorados na tentativa de distinguir dermatófitos, porém a associação de diferentes abordagens para a investigação da variabilidade intra e interespecífica de Trichophyton permanece escassa. Alguns trabalhos têm demonstrado que apesar de conservados, os fragmentos amplificados da seqüência correspondente à subunidade ribossomal menor 18S, contêm regiões conhecidas por sua variabilidade e capacidade de distinção entre espécies de levedura de importância médica, indicando que esta região também pode ser útil na diferenciação dos dermatófitos. Nesse estudo, a análise da seqüência do DNA ribossomal 18S foi combinada com critérios morfológicos e bioquímicos com o objetivo de se detectar possíveis diferenças genéticas entre sete isolados e estimar suas relações filogenéticas. Os resultados mostram que os isolados investigados pertencem a