Genetic variability of wild yellow plum (Ximenia americana L.) based on rapd markers

• Published in: Caatinga 2025, Vol.38
• Main Authors: Rêgo, Elizanilda R. do, Cabral, Laertty G. de S., Pessoa, Angela M. dos S., Moreira Filho, João E., Batista, Fabiane R. da C., Rêgo, Mailson M. do
• Format: Article
• Language: eng ; por
• Subjects: AGRICULTURE, DAIRY & ANIMAL SCIENCE; AGRONOMY; FISHERIES; FOOD SCIENCE & TECHNOLOGY; FORESTRY; VETERINARY SCIENCES
• ISSN: 0100-316X; 1983-2125; 1983-2125
• DOI: 10.1590/1983-21252025v3811873rc

ABSTRACT Several ethnobotanical studies highlighted the importance of yellow plum as a useful plant species in the Brazilian Northeast region. In order to domesticate and incorporate a native species in production systems it is necessary to obtain information on its development and genetic variation. This work aimed to analyze the genetic variability of individuals of X. americana, accessed by Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) molecular markers. 26 genotypes of X. americana, randomly collected at the private reserve Campo das Emas Farm located in the Caturité City, Paraíba State, Brazil, were used in the study. Through the RAPD technique it was possible to assess the genetic variations among native genotypes within a wild plum population. Based on Sokal and Rohlf dissimilarity coefficient it was possible to form four distinct groups using the UPGMA method. The Cophenetic Correlation Coefficient was 0.83, revealing variability in the consistency of the cluster pattern. The genotypes of X. americana have genetic diversity detected by RAPD markers, which have shown to be efficient in characterizing individuals. Genotypes 4, 8, 9, 11, 13, 14, 15, 16, 18, 21, 24, and 25 are the most divergent and should be used in conservation strategies and breeding programs. RESUMO Vários estudos etnobotânicos destacaram a importância da ameixa amarela como espécie vegetal útil no Nordeste brasileiro. Para domesticar e incorporar uma espécie nativa em sistemas produtivos é necessário obter informações sobre seu desenvolvimento e variação genética. Este trabalho teve como objetivo analisar a variabilidade genética de indivíduos de X. americana, acessada por marcadores moleculares amplificados ao acaso (RAPD). Foram utilizados 26 genótipos de X. americana, coletados na reserva particular Fazenda Canto das Emas, na cidade de Caturité, estado da Paraíba, Brasil. Por meio da técnica RAPD, foi possível avaliar as diferenças genéticas entre genótipos nativos em uma população de ameixa silvestre. Baseado no coeficiente de dissimilaridade de Sokas e Rohlf, foi possível formar quatro grupos distintos pelo método UPGMA. O coeficiente de correlação cofenética foi de 0,83, revelando variabilidade na consistência do padrão de agrupamento. Os genótipos de X. americana apresentam diversidade genética detectada por marcadores RAPD, que têm se mostrado eficientes na caracterização de indivíduos. Os genótipos 4, 8, 9, 11, 13, 14, 15, 16, 18, 21, 24, e 25 são os mais divergentes e devem se