基于肠道菌群预测摄入胆碱后血氧化三甲胺的变化

目的 建立基于肠道菌群预测摄入胆碱食物后体内氧化三甲胺(TMAO)代谢水平变化趋势的模型,为个体精准膳食提供指导,同时为潜在的心脑血管疾病高危人群筛选提供参考.方法 采集18位健康志愿者的空腹血清样本及食用等量胆碱食品8h后的血清样本,根据前后血清TMAO水平升降趋势,将志愿者分为升高组和降低组.采集粪便样品,对粪便样本DNA的16SrRNA基因V4可变区进行测序分析,比较两组志愿者的肠道菌群数据;根据肠道菌群及TMAO的数据,采用机器学习随机森林方法建立预测模型,并对模型进行检验.结果 升高组与降低组在反映肠道菌群β多样性的主坐标分析(PCOA)图展示明显的区分,两组肠道菌群物种多样性存在差...

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Published in:南方医科大学学报 2017, Vol.37 (3), p.290-295
Main Authors: 路浚齐, 王珊, 尹恝, 吴珊, 何彦, 郑慧敏, 盛华芳, 周宏伟
Format: Article
Language:Chinese
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Summary:目的 建立基于肠道菌群预测摄入胆碱食物后体内氧化三甲胺(TMAO)代谢水平变化趋势的模型,为个体精准膳食提供指导,同时为潜在的心脑血管疾病高危人群筛选提供参考.方法 采集18位健康志愿者的空腹血清样本及食用等量胆碱食品8h后的血清样本,根据前后血清TMAO水平升降趋势,将志愿者分为升高组和降低组.采集粪便样品,对粪便样本DNA的16SrRNA基因V4可变区进行测序分析,比较两组志愿者的肠道菌群数据;根据肠道菌群及TMAO的数据,采用机器学习随机森林方法建立预测模型,并对模型进行检验.结果 升高组与降低组在反映肠道菌群β多样性的主坐标分析(PCOA)图展示明显的区分,两组肠道菌群物种多样性存在差异;建立的预测模型曲线下面积为86.39％,95％置信区间为(72.7％,100％);验证集合代入模型显示降低组志愿者的TMAO变化水平被模型判定为降低的可能性明显高于升高组志愿者.结论 根据肠道菌群可以建立预测TMAO水平变化模型,模型预测效果良好.
ISSN:1673-4254
DOI:10.3969/j.issn.1673-4254.2017.03.02