胎盘植入组织lncRNA表达特征与ceRNA调控网络构建

目的 探讨lncRNA在胎盘植入中的表达特征及潜在的ceRNA调控机制.方法 随机选取2017年12月～2018年6月于我院行剖宫产合并胎盘植入的植入部分胎盘组织与邻近正常胎盘组织各5例,采用基因芯片技术检测组织lncRNA的表达水平;植入组与对照组比较,筛选差异表达lncRNAs;随机选取5个差异表达lncRNAs进行实时荧光定量PCR检测,验证基因芯片结果的准确性与可靠性,对差异表达基因进行GO功能聚类分析及KEGG通路分析;选取芯片扫描与qRT-PCR结果均显示显著差异的ENST00000511361(RP5-875H18.4)、NR_027457(LINC00221)和NR_12641...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:南方医科大学学报 2019, Vol.39 (10), p.1253-1259
Main Authors: 吴淑贞, 张慧珊, 刘雁, 王瑞, 叶少欣, 曾萌, 刘正平
Format: Article
Language:Chinese
Online Access:Get full text
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
cited_by
cites
container_end_page 1259
container_issue 10
container_start_page 1253
container_title 南方医科大学学报
container_volume 39
creator 吴淑贞
张慧珊
刘雁
王瑞
叶少欣
曾萌
刘正平
description 目的 探讨lncRNA在胎盘植入中的表达特征及潜在的ceRNA调控机制.方法 随机选取2017年12月～2018年6月于我院行剖宫产合并胎盘植入的植入部分胎盘组织与邻近正常胎盘组织各5例,采用基因芯片技术检测组织lncRNA的表达水平;植入组与对照组比较,筛选差异表达lncRNAs;随机选取5个差异表达lncRNAs进行实时荧光定量PCR检测,验证基因芯片结果的准确性与可靠性,对差异表达基因进行GO功能聚类分析及KEGG通路分析;选取芯片扫描与qRT-PCR结果均显示显著差异的ENST00000511361(RP5-875H18.4)、NR_027457(LINC00221)和NR_126415(FOXP4-AS1)3条lncRNAs构建ceRNA调控网络.结果 植入组与对照组比较,筛选出329个差异表达lncRNAs与179个差异表达mRNAs,实时荧光定量PCR变化趋势与芯片结果相一致;差异表达mRNAs主要参与TGF-β通路的调控;ceRNA调控网络的构建提示RP5-875H18.4--miRNA-218--SLIT2在胎盘植入的发生中存在潜在ceRNA调节机制.结论 差异表达lncRNAs可能通过调控TGF-β通路参与胎盘植入的发生发展过程,RP5-875H18.4--miRNA-218--SLIT2在胎盘植入的发生中存在潜在ceRNA调节机制,但该结果还需进一步验证.
doi_str_mv 10.12122/j.issn.1673-4254.2019.10.19
format article
fullrecord <record><control><sourceid>wanfang_jour</sourceid><recordid>TN_cdi_wanfang_journals_dyjydxxb201910019</recordid><sourceformat>XML</sourceformat><sourcesystem>PC</sourcesystem><wanfj_id>dyjydxxb201910019</wanfj_id><sourcerecordid>dyjydxxb201910019</sourcerecordid><originalsourceid>FETCH-wanfang_journals_dyjydxxb2019100193</originalsourceid><addsrcrecordid>eNpjYFAxNNAzNDI0MtLP0sssLs7TMzQzN9Y1MTI10TMyMLTUA0lbsjBwwoU5GHiLi7MMDAyMLI2MDU1MORnsXjT3PZ8949mS3qetS5_vbnm-uz0nLznIz_HFwhUv9u173rnz6b7GJzv6klNBYhuan_Utf7534vPdc57Na3m6excPA2taYk5xKi-U5mbQdHMNcfbQLU_MS0vMS4_Pyi8tygPKxKdUZlWmVFQkgRxmaAAkjElRCwDMqFb9</addsrcrecordid><sourcetype>Aggregation Database</sourcetype><iscdi>true</iscdi><recordtype>article</recordtype></control><display><type>article</type><title>胎盘植入组织lncRNA表达特征与ceRNA调控网络构建</title><source>Open Access: PubMed Central</source><creator>吴淑贞 ; 张慧珊 ; 刘雁 ; 王瑞 ; 叶少欣 ; 曾萌 ; 刘正平</creator><creatorcontrib>吴淑贞 ; 张慧珊 ; 刘雁 ; 王瑞 ; 叶少欣 ; 曾萌 ; 刘正平</creatorcontrib><description>目的 探讨lncRNA在胎盘植入中的表达特征及潜在的ceRNA调控机制.方法 随机选取2017年12月～2018年6月于我院行剖宫产合并胎盘植入的植入部分胎盘组织与邻近正常胎盘组织各5例,采用基因芯片技术检测组织lncRNA的表达水平;植入组与对照组比较,筛选差异表达lncRNAs;随机选取5个差异表达lncRNAs进行实时荧光定量PCR检测,验证基因芯片结果的准确性与可靠性,对差异表达基因进行GO功能聚类分析及KEGG通路分析;选取芯片扫描与qRT-PCR结果均显示显著差异的ENST00000511361(RP5-875H18.4)、NR_027457(LINC00221)和NR_126415(FOXP4-AS1)3条lncRNAs构建ceRNA调控网络.结果 植入组与对照组比较,筛选出329个差异表达lncRNAs与179个差异表达mRNAs,实时荧光定量PCR变化趋势与芯片结果相一致;差异表达mRNAs主要参与TGF-β通路的调控;ceRNA调控网络的构建提示RP5-875H18.4--miRNA-218--SLIT2在胎盘植入的发生中存在潜在ceRNA调节机制.结论 差异表达lncRNAs可能通过调控TGF-β通路参与胎盘植入的发生发展过程,RP5-875H18.4--miRNA-218--SLIT2在胎盘植入的发生中存在潜在ceRNA调节机制,但该结果还需进一步验证.</description><identifier>ISSN: 1673-4254</identifier><identifier>DOI: 10.12122/j.issn.1673-4254.2019.10.19</identifier><language>chi</language><publisher>佛山市胎儿医学研究所,广东 佛山 528000</publisher><ispartof>南方医科大学学报, 2019, Vol.39 (10), p.1253-1259</ispartof><rights>Copyright © Wanfang Data Co. Ltd. All Rights Reserved.</rights><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Uhttp://www.wanfangdata.com.cn/images/PeriodicalImages/dyjydxxb/dyjydxxb.jpg</thumbnail><link.rule.ids>314,780,784,4022,27921,27922,27923</link.rule.ids></links><search><creatorcontrib>吴淑贞</creatorcontrib><creatorcontrib>张慧珊</creatorcontrib><creatorcontrib>刘雁</creatorcontrib><creatorcontrib>王瑞</creatorcontrib><creatorcontrib>叶少欣</creatorcontrib><creatorcontrib>曾萌</creatorcontrib><creatorcontrib>刘正平</creatorcontrib><title>胎盘植入组织lncRNA表达特征与ceRNA调控网络构建</title><title>南方医科大学学报</title><description>目的 探讨lncRNA在胎盘植入中的表达特征及潜在的ceRNA调控机制.方法 随机选取2017年12月～2018年6月于我院行剖宫产合并胎盘植入的植入部分胎盘组织与邻近正常胎盘组织各5例,采用基因芯片技术检测组织lncRNA的表达水平;植入组与对照组比较,筛选差异表达lncRNAs;随机选取5个差异表达lncRNAs进行实时荧光定量PCR检测,验证基因芯片结果的准确性与可靠性,对差异表达基因进行GO功能聚类分析及KEGG通路分析;选取芯片扫描与qRT-PCR结果均显示显著差异的ENST00000511361(RP5-875H18.4)、NR_027457(LINC00221)和NR_126415(FOXP4-AS1)3条lncRNAs构建ceRNA调控网络.结果 植入组与对照组比较,筛选出329个差异表达lncRNAs与179个差异表达mRNAs,实时荧光定量PCR变化趋势与芯片结果相一致;差异表达mRNAs主要参与TGF-β通路的调控;ceRNA调控网络的构建提示RP5-875H18.4--miRNA-218--SLIT2在胎盘植入的发生中存在潜在ceRNA调节机制.结论 差异表达lncRNAs可能通过调控TGF-β通路参与胎盘植入的发生发展过程,RP5-875H18.4--miRNA-218--SLIT2在胎盘植入的发生中存在潜在ceRNA调节机制,但该结果还需进一步验证.</description><issn>1673-4254</issn><fulltext>true</fulltext><rsrctype>article</rsrctype><creationdate>2019</creationdate><recordtype>article</recordtype><recordid>eNpjYFAxNNAzNDI0MtLP0sssLs7TMzQzN9Y1MTI10TMyMLTUA0lbsjBwwoU5GHiLi7MMDAyMLI2MDU1MORnsXjT3PZ8949mS3qetS5_vbnm-uz0nLznIz_HFwhUv9u173rnz6b7GJzv6klNBYhuan_Utf7534vPdc57Na3m6excPA2taYk5xKi-U5mbQdHMNcfbQLU_MS0vMS4_Pyi8tygPKxKdUZlWmVFQkgRxmaAAkjElRCwDMqFb9</recordid><startdate>2019</startdate><enddate>2019</enddate><creator>吴淑贞</creator><creator>张慧珊</creator><creator>刘雁</creator><creator>王瑞</creator><creator>叶少欣</creator><creator>曾萌</creator><creator>刘正平</creator><general>佛山市胎儿医学研究所,广东 佛山 528000</general><general>南方医科大学附属佛山市妇幼保健院产科,广东 佛山,528000%南方医科大学附属佛山市妇幼保健院产科,广东 佛山 528000</general><scope>2B.</scope><scope>4A8</scope><scope>92I</scope><scope>93N</scope><scope>PSX</scope><scope>TCJ</scope></search><sort><creationdate>2019</creationdate><title>胎盘植入组织lncRNA表达特征与ceRNA调控网络构建</title><author>吴淑贞 ; 张慧珊 ; 刘雁 ; 王瑞 ; 叶少欣 ; 曾萌 ; 刘正平</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-wanfang_journals_dyjydxxb2019100193</frbrgroupid><rsrctype>articles</rsrctype><prefilter>articles</prefilter><language>chi</language><creationdate>2019</creationdate><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>吴淑贞</creatorcontrib><creatorcontrib>张慧珊</creatorcontrib><creatorcontrib>刘雁</creatorcontrib><creatorcontrib>王瑞</creatorcontrib><creatorcontrib>叶少欣</creatorcontrib><creatorcontrib>曾萌</creatorcontrib><creatorcontrib>刘正平</creatorcontrib><collection>Wanfang Data Journals - Hong Kong</collection><collection>WANFANG Data Centre</collection><collection>Wanfang Data Journals</collection><collection>万方数据期刊 - 香港版</collection><collection>China Online Journals (COJ)</collection><collection>China Online Journals (COJ)</collection><jtitle>南方医科大学学报</jtitle></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext</fulltext></delivery><addata><au>吴淑贞</au><au>张慧珊</au><au>刘雁</au><au>王瑞</au><au>叶少欣</au><au>曾萌</au><au>刘正平</au><format>journal</format><genre>article</genre><ristype>JOUR</ristype><atitle>胎盘植入组织lncRNA表达特征与ceRNA调控网络构建</atitle><jtitle>南方医科大学学报</jtitle><date>2019</date><risdate>2019</risdate><volume>39</volume><issue>10</issue><spage>1253</spage><epage>1259</epage><pages>1253-1259</pages><issn>1673-4254</issn><abstract>目的 探讨lncRNA在胎盘植入中的表达特征及潜在的ceRNA调控机制.方法 随机选取2017年12月～2018年6月于我院行剖宫产合并胎盘植入的植入部分胎盘组织与邻近正常胎盘组织各5例,采用基因芯片技术检测组织lncRNA的表达水平;植入组与对照组比较,筛选差异表达lncRNAs;随机选取5个差异表达lncRNAs进行实时荧光定量PCR检测,验证基因芯片结果的准确性与可靠性,对差异表达基因进行GO功能聚类分析及KEGG通路分析;选取芯片扫描与qRT-PCR结果均显示显著差异的ENST00000511361(RP5-875H18.4)、NR_027457(LINC00221)和NR_126415(FOXP4-AS1)3条lncRNAs构建ceRNA调控网络.结果 植入组与对照组比较,筛选出329个差异表达lncRNAs与179个差异表达mRNAs,实时荧光定量PCR变化趋势与芯片结果相一致;差异表达mRNAs主要参与TGF-β通路的调控;ceRNA调控网络的构建提示RP5-875H18.4--miRNA-218--SLIT2在胎盘植入的发生中存在潜在ceRNA调节机制.结论 差异表达lncRNAs可能通过调控TGF-β通路参与胎盘植入的发生发展过程,RP5-875H18.4--miRNA-218--SLIT2在胎盘植入的发生中存在潜在ceRNA调节机制,但该结果还需进一步验证.</abstract><pub>佛山市胎儿医学研究所,广东 佛山 528000</pub><doi>10.12122/j.issn.1673-4254.2019.10.19</doi></addata></record>
fulltext fulltext
identifier ISSN: 1673-4254
ispartof 南方医科大学学报, 2019, Vol.39 (10), p.1253-1259
issn 1673-4254
language chi
recordid cdi_wanfang_journals_dyjydxxb201910019
source Open Access: PubMed Central
title 胎盘植入组织lncRNA表达特征与ceRNA调控网络构建
url http://sfxeu10.hosted.exlibrisgroup.com/loughborough?ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info:ofi/enc:UTF-8&ctx_tim=2025-01-09T21%3A20%3A46IST&url_ver=Z39.88-2004&url_ctx_fmt=infofi/fmt:kev:mtx:ctx&rfr_id=info:sid/primo.exlibrisgroup.com:primo3-Article-wanfang_jour&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.genre=article&rft.atitle=%E8%83%8E%E7%9B%98%E6%A4%8D%E5%85%A5%E7%BB%84%E7%BB%87lncRNA%E8%A1%A8%E8%BE%BE%E7%89%B9%E5%BE%81%E4%B8%8EceRNA%E8%B0%83%E6%8E%A7%E7%BD%91%E7%BB%9C%E6%9E%84%E5%BB%BA&rft.jtitle=%E5%8D%97%E6%96%B9%E5%8C%BB%E7%A7%91%E5%A4%A7%E5%AD%A6%E5%AD%A6%E6%8A%A5&rft.au=%E5%90%B4%E6%B7%91%E8%B4%9E&rft.date=2019&rft.volume=39&rft.issue=10&rft.spage=1253&rft.epage=1259&rft.pages=1253-1259&rft.issn=1673-4254&rft_id=info:doi/10.12122/j.issn.1673-4254.2019.10.19&rft_dat=%3Cwanfang_jour%3Edyjydxxb201910019%3C/wanfang_jour%3E%3Cgrp_id%3Ecdi_FETCH-wanfang_journals_dyjydxxb2019100193%3C/grp_id%3E%3Coa%3E%3C/oa%3E%3Curl%3E%3C/url%3E&rft_id=info:oai/&rft_id=info:pmid/&rft_wanfj_id=dyjydxxb201910019&rfr_iscdi=true