益气解毒方治疗原发性肝癌的作用机制:基于网络药理学及分子对接方法

目的 通过网络药理学及分子对接探究益气解毒方的有效成分及其作用于原发性肝癌的主要生物过程及信号通路,阐明益气解毒方治疗原发性肝癌的作用机制.方法 通过TCMSP、Uniport、Genecards、String等数据库,以及Cytoscape3.8.2软件得出药物、疾病最终靶点基因;通过David数据库对药物-疾病共有基因做GO、KEGG富集分析;通过Pubcham、RCSB、Autoduck将药物有效成分与最终核心基因进行分子对接;通过细胞活力检测、Western blot、实时荧光定量PCR实验研究不同浓度的益气解毒方对于核心基因DHX9、HNRNPK、NCL、PABPC1表达的影响.结果...

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Published in:南方医科大学学报 2022, Vol.42 (6), p.805-814
Main Authors: 徐朦, 张鹏, 张国梁
Format: Article
Language:Chinese
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Summary:目的 通过网络药理学及分子对接探究益气解毒方的有效成分及其作用于原发性肝癌的主要生物过程及信号通路,阐明益气解毒方治疗原发性肝癌的作用机制.方法 通过TCMSP、Uniport、Genecards、String等数据库,以及Cytoscape3.8.2软件得出药物、疾病最终靶点基因;通过David数据库对药物-疾病共有基因做GO、KEGG富集分析;通过Pubcham、RCSB、Autoduck将药物有效成分与最终核心基因进行分子对接;通过细胞活力检测、Western blot、实时荧光定量PCR实验研究不同浓度的益气解毒方对于核心基因DHX9、HNRNPK、NCL、PABPC1表达的影响.结果 筛选得出8个最终核心基因:DDX5、HNRNPK、PABPC1、DHX9、RPS3A、RPS3、RPL13、NCL.GO分析显示:主要生物过程为Ephrin receptor signaling pathway、Movement of cell or subcellular component、Blood microparticle、Focal adhesion、Iron ion binding;KEGG分析显示:Ras信号通路的基因数最多.分子对接结果显示药物有效成分与最终核心基因均可以在自然条件下进行对接,其中PABPC1与Stigmasterol结合能最高.Western blot、实时荧光定量PCR实验结果显示,当含药血清浓度逐渐增大时,细胞活力逐渐受到抑制(P
ISSN:1673-4254
DOI:10.12122/j.issn.1673-4254.2022.06.03