硫化镍转化人支气管上皮细胞基因差异表达芯片的研究

背景与目的近年研究发现硫化镍（NiS）可引起人支气管上皮细胞（human bronchial epithelial cell，16HBE）发生恶性转化及转化细胞致癌性，其机制可能与NiS引起基因突变、多种转录因子的异常表达有关。为此，本研究利用NiS恶性转化的体外培养细胞模型，用cDNA微阵列技术研究经NiS转化后的16HBE细胞基因的差异表达，从基因组水平探讨NiS所致细胞恶变的相关基因差异改变。方法分别提取16HBE和经NiS单独处理发生转化的NiS-16HBE细胞的总RNA，逆转录合成cDNA并以Cy3-dCTP和Cy5-dCTP荧光素分别标记制作探针。探针混合后与含4000个人类基因的...

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Published in:Zhongguo fei ai za zhi 2005, Vol.8 (5), p.412-418
Main Author: 宾晓农 吕嘉春 谭敏 纪卫东 陈家堃
Format: Article
Language:Chinese
Subjects:
人支气管上皮细胞
基因芯片
硫化镍
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Description
Summary:背景与目的近年研究发现硫化镍（NiS）可引起人支气管上皮细胞（human bronchial epithelial cell，16HBE）发生恶性转化及转化细胞致癌性，其机制可能与NiS引起基因突变、多种转录因子的异常表达有关。为此，本研究利用NiS恶性转化的体外培养细胞模型，用cDNA微阵列技术研究经NiS转化后的16HBE细胞基因的差异表达，从基因组水平探讨NiS所致细胞恶变的相关基因差异改变。方法分别提取16HBE和经NiS单独处理发生转化的NiS-16HBE细胞的总RNA，逆转录合成cDNA并以Cy3-dCTP和Cy5-dCTP荧光素分别标记制作探针。探针混合后与含4000个人类基因的芯片杂交。以ScanArray 4000扫描仪扫描芯片，以GenPix Pro3．0软件分析荧光信号，然后对差异表达的基因进行生物学信息分析。结果NiS-16HBE细胞样本与16HBE细胞样本比较，呈现差异表达的基因有151个（3．78％），其中81个（53．64％）上调，70个（46．36％）下调。结论NiS的转化作用与应激反应基因、免疫相关基因、DNA合成和修复基因、代谢相关基因、原癌基因和抑癌基因等多类基因的异常表达有关。
ISSN:1009-3419
1999-6187