The Reaction Coordinate of a Bacterial GH47 α-Mannosidase: A Combined Quantum Mechanical and Structural Approach

Informationen über mögliche Inhibitionsstrategien und Mannosidsynthesen liefert eine Konformationsanalyse der enzymatischen Mannosidhydrolyse. Strukturen in atomarer Auflösung entlang der Reaktionskoordinate machen deutlich, wie eine invertierende α‐Mannosidase ihr Substrat und den Übergangszustand...

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Published in:Angewandte Chemie 2012-10, Vol.124 (44), p.11159-11163
Main Authors: Thompson, Andrew J., Dabin, Jerome, Iglesias-Fernández, Javier, Ardèvol, Albert, Dinev, Zoran, Williams, Spencer J., Bande, Omprakash, Siriwardena, Aloysius, Moreland, Carl, Hu, Ting-Chou, Smith, David K., Gilbert, Harry J., Rovira, Carme, Davies, Gideon J.
Format: Article
Language:English
Subjects:
Computerchemie
Enzymmechanismen
Glycosidase-Hemmer
Konformationsanalyse
Mannose
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Description
Summary:Informationen über mögliche Inhibitionsstrategien und Mannosidsynthesen liefert eine Konformationsanalyse der enzymatischen Mannosidhydrolyse. Strukturen in atomarer Auflösung entlang der Reaktionskoordinate machen deutlich, wie eine invertierende α‐Mannosidase ihr Substrat und den Übergangszustand verzerrt. QM/MM‐Rechnungen zeigen die Verformung der Freie‐Energie‐Fläche von isolierter α‐D‐Mannose bei der enzymatischen Umsetzung, für die nur ein konformativer Reaktionsverlauf möglich wird.
ISSN:0044-8249
1521-3757
DOI:10.1002/ange.201205338