Épidémiologie moléculaire du virus de l'hépatite C

• Published in: Revue française des laboratoires 2000-02, Vol.2000 (320), p.41-48
• Main Authors: Thiers, Valérie, Tuveri, Rosella, Bréchot, Christian
• Format: Article
• Language: fre
• Subjects: epidemiology; genotype; génotype; Hepatitis C; Hépatite C; molecular study; phylogeny; phylogénie; épidémiologie; étude moléculaire
• ISSN: 0338-9898
• DOI: 10.1016/S0338-9898(00)80395-9

Les données recueillies par les techniques moléculaires (PCR, données de séquence) ont largement contribué à la compréhension et à la connaissance de l'épidémiologie de l'infection par le virus de l'hépatite C (VHC). L'utilisation des techniques de typage moléculaire a permis de préciser la répartition géographique des génotypes du VHC et d'apprécier l'étendue de l'épidémie à travers le monde. Ces données ont ainsi permis de reconstruire l'origine géographique et les voies de diffusion de l'infection. De plus, elles ont été à l'origine de l'identification de plusieurs grandes épidémies d'infection par ce virus. L'analyse des séquences nucléotidiques d'isolats du VHC a fourni des informations complémentaires qui ont conforté les premières observations. En particulier, le calcul du taux de substitutions a permis d'estimer la date de divergence des génotypes, et par extrapolation, de dater l'origine du premier ancêtre commun. Enfin, une comparaison détaillée des séquences, associée à la recherche de liens phylogéniques entre les souches virales permet d'établir une chaîne de transmission entre individus. Molecular techniques (PCR, sequence analysis) have allowed to data that greatly contributed to the knowledge and understanding of the epidemiology of Hepatitis C virus (HCV). Genotyping assays provided informations on his worlwide distribution and on the distinct geographical repartition of some types. These molecular data allow to the reconstruction of virus origin and routes of transmission. Furthermore, they led to the identification of several large-scale outbreaks of HCV infection. Nucleotide sequence analysis has provided additional informations that strengths the first observations. In particular, the evaluation of HCV gene nucleotide mutation rates have led to calculation of divergence times between genotypes, and after extrapolation, to date the common ancestor of different types of HCV. These informations are in agreement with their present geographical distribution. Finally, information from nucleic acid sequences may be used to infer phylogenetic relationships among virus variants. This approach has been used to investigate possible transmission events between pair of individuals.