Évaluation du microbiote dans le cas des maladies inflammatoires chroniques du tractus digestif

• Published in: Nutrition clinique et métabolisme 2023-05, Vol.37 (2), p.e99-e100
• Main Author: Bekada, D.E.
• Format: Article
• Language: fre
• ISSN: 0985-0562; 1768-3092
• DOI: 10.1016/j.nupar.2023.03.185

La présente étude a porté sur l’isolement et l’identification de l’écosystème bactérien gastrique et intestinal impliqués, d’une part, dans la pathologie de la gastrite de type B et, d’autre part, dans la maladie de Crohn et la rectocolite hémorragique. Les maladies inflammatoires chroniques intestinales posent un problème de recherche scientifique et non à visé diagnostique où interviennent un dysfonctionnement immunitaire et une dysbiose bactérienne. Le pronostic est sombre et l’évolution se traduit par des cancers. L’échantillonnage portait sur une centaine d’individu où les patients étaient de sexe masculin et féminin avec un intervalle d’âge compris entre 18 et 60 ans. L’isolement effectué après broyage des différentes biopsies récoltées par le biais d’endoscopie haute et basse, sur des milieux de culture sélectives spécifiques et suite aux tests biochimiques, ont permis de sélectionner un microbiote considéré par un ensemble de bactéries appartenant à l’écosystème gastrique et intestinal. Les données ont été identifiées sur le plan phénotypique par l’emploi de tests biochimique, les différentes galeries API, puis génotypiquement grâce à l’utilisation de la réaction de polymérisation en chaîne (PCR). En revanche, l’étude anatomopathologique avait permit de poser et confirmé les différents diagnostics des pathologies correspondant à notre étude de recherche. Au cours de l’observation microscopique à la coloration de Gram, dans le cas de la Gastrite B, on avait observé que les bacilles à Gram négatifs étaient surtout considérés par les genres et espèces, Hélicobactere pylori et Proteus mirabilis, secondairement par les bacilles à Gram positifs représentés par Bacillus cereus, et Lactobacille sp. et en dernière position par les coccis à gram positif identifiés comme étant Streptococus entericus et puis Staphylococus aureus. En parallèle, dans le cas de la maladie de Crohn et de la rectocolite hémorragique, l’identification par la coloration de Gram est majoritairement représentée par les bacilles à Gram positifs identifiés comme étant Clostridium difficile et Bacillus subtilis, et par les bacilles à Gram négatifs en faveur d’Enterobacter cloacae. L’antibiogramme nous a permis de faire un choix vers d’autres antibiotiques qui ont la faculté de rendre par le biais de leurs principes actifs ces souches bactériennes sensibles pouvant aboutir à l’inhibition ou à affaiblir l’effet toxinogène de ces bactéries. L’utilisation du test d’inhibition par les bactérie