A rapid detection method for PAI-1 promoter insertion/deletion polymorphism (4G/5G)

• Published in: Genetics and molecular biology 1998-09, Vol.21 (3), p.315-316
• Main Authors: Annichino-Bizzacchi, Joyce M., Pugliese, Luciana, Arruda, Valder R.
• Format: Article
• Language: English
• Subjects: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY; GENETICS & HEREDITY
• ISSN: 1415-4757; 1678-4685; 1415-4757; 1678-4685
• DOI: 10.1590/S1415-47571998000300004

Plasminogen activator inhibitor-1 (PAI-1) is an important inhibitor of fibrinolysis, and increased levels of PAI-1 are associated with atheroma and myocardial infarction. A common 4G/5G insertion/deletion polymorphism located in the promoter region of PAI-1 gene has been described associated with PAI-1 activity in plasma levels. Genotyping of this polymorphism is commonly conducted with an allele-specific oligonucleotide melting technique. In the present study, we describe a quick, easy method for genotyping 4G/5G polymorphism in the promoter region of the PAI-1 gene. O inibidor do ativador do plasminogênio-1 (PAI-1) é o inibidor principal da fibrinólise. Estudos populacionais prospectivos e retrospectivos demonstraram que níveis plasmáticos elevados de atividade do PAI-1 são um fator de risco para doença coronariana isquêmica. Recentemente descreveu-se um polimorfismo de inserção/deleção (4G/5G), localizado na região promotora do gene do PAI-1, relacionado aos níveis plasmáticos do PAI-1. A presença do alelo 4G está associada a níveis elevados de atividade do PAI-1. A metodologia comumente empregada para a determinação desse polimorfismo é a amplificação do DNA pela PCR, utilizando-se oligonucleotídeos alelo-específicos. Esta técnica demanda tempo e em análises populacionais, que geralmente avaliam um elevado número de amostras, técnicas otimizadas seriam de grande interesse. Neste artigo descrevemos a determinação deste polimorfismo pela técnica de PCR e SSCP, utilizando o aparelho PhastSystem. Este método mostrou-se uma alternativa ao método anterior, de fácil realização e com resultados reprodutíveis.