Informative prior distribution applied to linseed for the estimation of genetic parameters using a small sample size

• Published in: Pesquisa agropecuaria brasileira 2022, Vol.57
• Main Authors: Azevedo, Camila Ferreira, Carvalho, Ivan Ricardo, Nascimento, Moysés, Silva, José Antonio Gonzalez da, Nascimento, Ana Carolina Campana, Cruz, Cosme Damião, Huth, Caroline, Almeida, Helaine Claire Ferreira de
• Format: Article
• Language: English
• Subjects: AGRICULTURE, DAIRY & ANIMAL SCIENCE; AGRICULTURE, MULTIDISCIPLINARY; flaxseed; Linum usitatissimum; plant breeding
• ISSN: 0100-204X; 1678-3921; 1678-3921
• DOI: 10.1590/s1678-3921.pab2022.v57.02793

Abstract The objective of this work was to evaluate a procedure for the elicitation of informative prior distribution, compared with non-informative prior distribution, in a small sample size, using 14 traits of three linseed (Linum usitatissimum) genotypes in seven sowing seasons. The values of the hyperparameters regulate the informativeness of the prior distribution; therefore, for each season, the hyperparameters to be used in the next season were calculated. The two prior distributions, non-informative and informative, were compared by the length of the credible interval and variance of the posterior distribution. In general, when the informative prior distribution is adopted, the genetic parameters present a shorter length of the credible interval and more precise estimates. The mechanism for informative prior elicitation using previous information from breeding programs is efficient for the estimation of genetic parameters, including heritability and genetic variance, even when the sample size is small. In genetic evaluation, the use of informative prior distribution is better than that of non-informative distribution for a small sample size. In general, the results of the informative prior distributions are indicative that the genetic values of the first sowing season are greater for the following traits: cycle length, plant height, and number of non-grained capsules and of productive branches. Resumo O objetivo deste trabalho foi avaliar um procedimento para elicitação de distribuição a priori informativa, comparada à distribuição a priori não informativa, em tamanho amostral reduzido, com uso de 14 caracteres de três genótipos de linhaça (Linum usitatissimum), em sete épocas de semeadura. Os valores dos hiperparâmetros regulam a informatividade da distribuição a priori; portanto, para cada época, foram calculados os hiperparâmetros a serem utilizados na próxima época. As duas distribuições a priori, não informativa e informativa, foram comparadas pelo comprimento dos intervalos de credibilidade e pela variância da distribuição a posteriori. Em geral, quando a distribuição a priori informativa é adotada, os parâmetros genéticos apresentam menor comprimento do intervalo de credibilidade e estimativas mais precisas. O mecanismo de elicitação a priori informativa com uso de informações prévias de programas de melhoramento é eficiente para estimativa de parâmetros genéticos, incluindo herdabilidade e variância genética, mesmo quando o tamanho da amost