Agrobiodiversity in Cucurbita spp. landraces collected in Rio de Janeiro assessed by molecular markers

• Published in: Crop breeding and applied biotechnology 2012-06, Vol.12 (2), p.96-103
• Main Authors: Santos, M.H. dos, Rodrigues, R, Gonçalves, L.S.A, Sudré, C.P, Pereira, M.G
• Format: Article
• Language: English
• Subjects: ABÓBORA; Agrobiodiversity; AGRONOMY; BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY; CUCURBITA; CUCURBITA SP; genetic distance; GENETIC MARKERS; GENETIC RESOURCES; GERMOPLASM A; GERMOPLASMA; GERMPLASM; germplasm characterization; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_2007; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_24030; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_3218; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_3249; MARCADOR MOLECULAR; MARCADORES GENA©TICOS; MARQUEUR GA©NA©TIQUE; molecular characterization; on farm conservation; RECURSO GENÉTICO; RECURSOS GENA©TICOS; RESSOURCE GA©NA©TIQUE
• ISSN: 1518-7853; 1984-7033; 1984-7033
• DOI: 10.1590/S1984-70332012000200001

Diversity and genetic relationship in forty landraces of Cucurbita spp. collected at small farms in Rio de Janeiro, Brazil, were analyzed by RAPD and ISSR markers, using 20 and 15 primers, respectively. Both markers were efficient to cluster the accessions separating among species, but not so much to the detection of intra-specific variability, considering the event of different pairs of accessions comprising null genetic distances observed for both markers in C. moschata. Low values observed for genetic distance among the C. moschata landraces showed that most likely genetic losses is in progress in that region of cultivation due to anthropic and market pressure, which are stimulating the small farmers to abandon their local varieties in order to use commercial seeds, including hybrids, which is causing risk of genetic erosion. Divergência genética entre 40 variedades locais de Cucurbita spp coletada em propriedades rurais no Rio de janeiro foi analisada por marcadores RAPD e ISSR usando 20 e 15 iniciadores, respectivamente. Ambos os marcadores foram eficientes em promover a separação entre as espécies, mas não tanto para a detecção de variabilidade intra-específica, considerando o caso de diferentes pares de acessos compreendendo distâncias genéticas nulas observadas para ambos os marcadores em C. moschata. Baixos valores foram registrados para distância genética entre variedades locais de C. moschata sugerindo que a erosão genética pode estar ocorrendo na região de cultivo devido, entre outros fatores, à pressão antrópica e a exigências do mercado consumidor, que estimulam os pequenos produtores a trocarem suas variedades locais por híbridos comerciais.