Genetic characterization of cotton landraces found in the Paraíba and Rio Grande do Norte states

• Published in: Crop breeding and applied biotechnology 2015-03, Vol.15 (1), p.26-32
• Main Authors: Menezes, Ivandilson Pessoa Pinto de, Hoffmann, Lúcia Vieira, Barroso, Paulo Augusto Vianna
• Format: Article
• Language: English
• Subjects: AGRONOMY; BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY; conservation; Cotton; genetic structure; Gossypium hirsutum; microsatellite markers
• ISSN: 1984-7033; 1518-7853; 1984-7033
• DOI: 10.1590/1984-70332015v15n1a4

The objective of this study was to estimate genetic diversity of cotton mocó planted in Paraíba and Rio Grande do Norte using microsatellite markers, since mocó landraces are a valuable source of genetic diversity. A set of 38 accessions - 21 plants from Rio Grande do Norte and 17 from Paraiba - was analyzed using 24 pairs of cotton microsatellite primers, which amplified 20 polymorphic loci. The average inbreeding was 0.432, and was slightly higher in individuals from Paraíba than from Rio Grande do Norte. Genetic diversity (Nei´s unbiased estimator) between individuals from each state's populations had similar values (HT = 0.327 and 0.302 in Paraíba and Rio Grande do Norte, respectively), indicating that comparable variability has been maintained. Moreover, the proportion of diversity between populations was extremely low (DST = 0.007), but expressive between mesoregions (DST = 0.069). These data led us to conclude that the genetic similarities between populations are high. Variedades locais de algodão são fontes valiosas de diversidade genética. O objetivo deste estudo foi estimar a diversidade genética de algodoeiro mocó plantado na Paraíba e Rio Grande do Norte, utilizando marcadores de microssatélites. Um conjunto de 38 acessos - 21 plantas do Rio Grande do Norte e 17 da Paraíba - foi analisadas usando 24 pares de primers de microssatélites de algodão, que amplificaram 20 locos polimórficos. A média do índice de fixação foi de 0,432 e foi ligeiramente maior nos indivíduos da Paraíba do que do Rio Grande do Norte. A diversidade genética de Nei entre as amostras de cada estado apresentou valores similares (HT = 0,327 e 0,302 na Paraíba e Rio Grande do Norte, respectivamente), indicando que uma diversidade genética similar tem sido mantida. Logo, a proporção da diversidade genética entre as populações foi extremamente baixa (DST = 0,007), mas expressiva entre as mesorregiões (DST = 0,069). Conforme os dados, conclui-se que a similaridade genética entre as populações é alta.