A computational approach for Leishmania genus protozoa detection in bone marrow samples from patients with visceral Leishmaniasis

• Published in: Archivos venezolanos de farmacología y terapéutica 2020-01, Vol.39 (7), p.912-919
• Main Authors: Isaza-Jaimes, Angélica, Bermúdez, Valmore, Bravo, Antonio, Castrillo, Jhoalmis Sierra, Lalinde, Juan Diego Hernández, Fossi, Cleiver A, Flórez, Anderson, Rodríguez, Johel E
• Format: Article
• Language: English
• Subjects: Bone marrow; Microscopy; Protozoa; Smartphones
• ISSN: 0798-0264; 2610-7988

Este artículo reporta un enfoque computacional en tres etapas para la detección automática de protozoos del género Leishmania en microfotografías a partir de muestras de médula ósea extraídas de pacientes con Leishmaniasis visceral. La primera etapa correspondió al preprocesamiento de las imágenes de microscopía, en la que inicialmente se aplicó un filtro de paso baio para atenuar la información no deseada asociada a las imágenes y preservar los bordes en los obietos. La etapa de preprocesamiento concluyó con la aplicación de operadores de gradiente a las imágenes suavizadas para enfatizar los cambios de las intensidades asociadas con los bordes de los protozoos. En la segunda etapa se elaboró un procedimiento orientado a la selección de las regiones de interés candidatas a contener parásitos, sobre la base del análisis de intensidad asociado a un coniunto de perfiles seleccionados a partir de las imágenes suavizadas. En la etapa final, cada región de interés que contenía protozoos fue analizada en el módulo de gradiente mediante una técnica basada en mapas polares de forma de clasificar su contenido como parásito del género Leishmania. La aplicación del enfoque computacional propuesto generó un porcentaie de reconocimiento del parásito de aproximadamente el 80%.