Fungal endophytes in woody roots of Douglas-fir (Pseudotsuga menziesii) and ponderosa pine (Pinus ponderosa)

• Published in: Forest pathology = Journal de pathologie forestière = Zeitschrift für Forstpathologie 2004-08, Vol.34 (4), p.255-271
• Main Authors: Hoff, J. A., Klopfenstein, N. B., McDonald, G. I., Tonn, J. R., Kim, M.-S., Zambino, P. J., Hessburg, P. F., Rogers, J. D., Peever, T. L., Carris, L. M.
• Format: Article
• Language: English
• Subjects: Biological and medical sciences; Byssochlamys nivea; Fundamental and applied biological sciences. Psychology; Phytopathology. Animal pests. Plant and forest protection; Pinus ponderosa; Pseudotsuga menziesii
• ISSN: 1437-4781; 1439-0329
• DOI: 10.1111/j.1439-0329.2004.00367.x

Summary The fungal community inhabiting large woody roots of healthy conifers has not been well documented. To provide more information about such communities, a survey was conducted using increment cores from the woody roots of symptomless Douglas‐fir (Pseudotsuga menziesii) and ponderosa pine (Pinus ponderosa) growing in dry forests on the eastern slope of the Cascade Mountains in Washington state, USA. Fungal isolates were cultured on standard media, and then were identified using a combination of molecular and morphological methods. Fungal genera and species identified in this study will provide baseline data for future surveys of fungal endophytes. Examination of internal transcribed spacer (ITS1 and ITS2) and 5.8S rDNA sequences and morphology of cultured fungi identified 27 fungal genera. Two groups predominated: Byssochlamys nivea Westling (20.4% of isolations) and Umbelopsis species (10.4% of isolations). This is the first report of B. nivea within large woody roots of conifers. Both taxa have been previously identified as potential biological control agents. Although some trends were noted, this study found no significant evidence of host species or plant association effects on total recovery of fungal endophytes or recovery of specific fungal taxa. Résumé La communauté fongique des grosses racines de conifères sains est mal connue. Pour apporter des informations dans ce domaine, une prospection a été réalisée en utilisant des carottes de sondage dans les racines de Douglas (Pseudotsuga menziesii) et de Pin ponderosa (Pinus ponderosa) asymptomatiques poussant dans les forêts sèches du versant oriental des Cascade Mountains dans l'Etat de Washington, USA. Les isolats fongiques ont été cultivés sur des milieux classiques et identifiés en utilisant une combinaison de méthodes morphologiques et moléculaires. Les genres et espèces fongiques identifiés dans cette étude pourront servir de données de référence pour de futures études sur les champignons endophytes. 27 genres ont été identifiés à partir de la séquence des ITS1, ITS2 et 5.8S rDNA et de la morphologie en culture. Deux groupes sont prédominants: Byssochlamys nivea Westling (20.4% des isolements) et Umbelopsis species (10.4% des isolements). Cette étude constitue la première mention de ces champignons dans des grosses racines de conifères. Les deux taxons ont été précédemment identifiés comme des agents potentiels de lutte biologique. Bien que certaines tendances soient observées, aucun effet