Genetic heterogeneity and population structure in eastern India: Red cell enzyme variability in ten Assamese populations

• Published in: Zeitschrift für Morphologie und Anthropologie 1989, Vol.77 (3), p.287-296
• Main Authors: Mukherjee, B. N., Malhotra, K. C., Roy, M., Banerjee, S., Walter, H., Chakraborty, R.
• Format: Article
• Language: English
• Subjects: allele frequencies; Alleles; Asian Continental Ancestry Group - genetics; Assam; Blood proteins; Brahmins; Enzymes; Erythrocytes - enzymology; European Continental Ancestry Group - genetics; Gene frequency; genetic distances; genetic study; Human genetics; Humans; India; Muslims; Phenotypes; polymorphism; Population genetics; Population structure; red cell enzyme; sub-clusters; tribes
• ISSN: 0044-314X
• DOI: 10.1127/zma/77/1989/287

This paper is a part of the genetic study of the people of Assam (eastern India), initiated by the Anthropometry and Human Genetics Unit, Indian Statistical Institute, Calcutta, India, and the Dept. of Human Biology / Physical Anthropology, University of Bremen, W. Germany. The results of 1. allele distribution of five red cell enzyme polymorphisms in ten Assamese populations, 2. heterogeneity of allele frequencies and extent of gene differentiation among these populations, and 3. standard genetic distances are presented here. A total of 1024 blood samples was screened for aP, E D, AK, ADA and LDH enzyme systems for Brahmins, Kalitas, Kaibartas, Rajbanshis, Muslims, Ahoms, Chutiyas, Kacharis, Karbis (Mikirs) and Sonowals, of which the latter three are tribes. The gene diversity (Fst) is smallest (0.0035) for pa and highest (0.1604) for HbE. The total Fst value (0.0399 ± 0.0141) appears to be statistically significant. From distance analysis two major clusters with sub-clusters in each are visible, which are in conformity with the ethnohistory of these populations. Diese Untersuchung ist Teil eines populationsgenetischen Forschungsprojektes an der Bevölkerung von Assam (Ostindien), das gemeinsam von der Anthropometry and Human Genetics Unit, Indian Statistical Institute, Calcutta, Indien, sowie dem Dept. f. Humanbiologie/Anthropologie der Universität Bremen, Bundesrepublik Deutschland, initiiert und durchgeführt wurde. Hier werden 1. die Allelenverteilungen für fünf polymorphe Emzymsysteme in zehn Populationen, 2. die Heterogenität der Allelenfrequenzen und das Ausmaß der genetischen Differenzierung zwischen diesen Populationen sowie 3. die genetischen Abstände zwischen ihnen vorgestellt und diskutiert. Insgesamt konnten 1024 Individuen bezüglich der polymorphen Systeme aP, EsD, AK, ADA und LDH typisiert werden. Die untersuchten Populationen sind Brahmins, Kalitas, Kaibartas, Rajbanshis, Muslims, Ahoms, Chutiyas, Kacharis, Karbis (Mikirs) und Sonowals; bei den drei letzteren handelt es sich um Stammesbevölkerungen. Die gene diversity (Fst) ist für pa am kleinsten (0.0035), für HbE am größten (0.1604). Der Gesamt-Fst-Wert (0.0399 ± 0.0141) dürfte statistisch signifikant sein. Die genetische Abstandsanalyse läßt zwei Hauptcluster erkennen, wobei jedes Subcluster enthält. Diese Cluster stehen mit der Bevölkerungsgeschichte der untersuchten Populationen im Einklang.